廣東省中藥研究所始建于1955年9月，1986年加掛廣東南藥研究所，時歸廣東省食品藥品監督管理局管理，2012年起劃轉廣東省衛生計劃委員會管理,2016年成建制劃轉廣東省教育廳管理的事業單位。主要從事中藥資源與規范化栽培研究、中藥質量分析與檢測、藥物與保健食品研發、中藥化妝品研發等多方面的科研工作。1998年與廣東食品藥品職業學院合并，被省人民政府納入六十九家省直屬的全民所有制的科研機構管理范圍；在2012年事業單位分類改革中，被劃為公益三類科研單位。現有在職人員39人，其中博士6人、碩士5人、高級職稱16人、中級職稱10人。研究所下設行政人事中心、財務中心、開發中心、南藥資源研發中心、藥品與保健食品研發中心、中藥化妝品研發中心、中藥炮制研發中心、中藥藥膳研發中心、中藥分析檢測中心、中藥技能培訓中心、華南醫用營養食品研發中心、優創中心等部門。